Chwazi bon an tib san ADN san selil se kritik pou asire analiz cfDNA serye. Echantiyon Plasma yo kolekte nan tib espesyalize yo demontre estabilite siperyè ak kontaminasyon redwi konpare ak echantiyon serom. Etid yo revele sa Tib EDTA, lè yo trete nan sis èdtan, bay pi bon kondisyon pou analiz ctDNA. Sepandan, reta nan pwosesis ka konpwomi bon jan kalite echantiyon. Sistèm koleksyon san bon jan kalite, tankou tib PAXgene, minimize emoliz ak prezève entegrite cfDNA sou peryòd pwolonje. Avansman sa yo mete aksan sou enpòtans chwa tib nan kenbe sede cfDNA, pite, ak estabilite, ki esansyèl pou tou de rechèch ak aplikasyon klinik.
Tib EDTA yo se yo ki pi souvan itilize yo tib san ADN san selil nan tou de rechèch ak anviwònman klinik. Tib sa yo apwopriye pou kolekte echantiyon plasma pou analiz cfDNA, patikilyèman sikile ADN timè (ctDNA). Sepandan, efikasite yo depann sou pwosesis alè. Preparasyon Plasma ta dwe fèt nan sis èdtan nan koleksyon pou anpeche kontaminasyon ak ADN jenomik (gDNA) epi asire estabilite cfDNA. Pandan ke tib EDTA yo pri-efikas ak lajman disponib, yo ka pa fè kòm byen ke tib espesyalize lè reta nan pwosesis rive.
Tib Streck yo espesyalize tib koleksyon san fèt pou prezève entegrite cfDNA sou peryòd pwolonje. Tib sa yo gen ajan estabilize ki anpeche liz selil, diminye risk pou kontaminasyon gDNA. Tib Streck depase tib EDTA nan kenbe bon jan kalite cfDNA pandan transpò ak depo, sa ki fè yo ideyal pou senaryo kote pwosesis imedya pa posib. Kapasite yo pou estabilize cfDNA pou jou san kondisyon kontwole te fè yo yon chwa pi pito pou anpil chèchè ak klinisyen.
BCT ADN san selil se yon lòt opsyon avanse pou analiz cfDNA. Tib sa yo fèt pou pwolonje estabilite cfDNA lè yo anpeche degradasyon ak kontaminasyon. Yo patikilyèman itil pou etid ki mande depo pwolonje oswa transpò echantiyon plasma. Lè yo minimize varyasyon pre-analitik, tib sa yo amelyore efikasite ekstraksyon cfDNA ak sede, fè yo yon chwa serye pou aplikasyon pou gwo presizyon.
Nan rechèch, tib san ADN san selil jwe yon wòl enpòtan nan prezève cfDNA pou aplikasyon en. Yo asire entegrite ak estabilite nan cfDNA, ki pèmèt analiz egzat nan byomarkè tankou ctDNA. Chèchè yo konte sou tib sa yo pou anpeche kontaminasyon ak gDNA, ki ka konpwomèt validite rezilta yo. Anplis de sa, tib espesyalize pèmèt pou depo pwolonje ak transpò, fasilite etid gwo echèl ak kolaborasyon milti-sit.
Nan anviwònman klinik, tib sa yo sipòte analiz cfDNA pou rezon dyagnostik ak pronostik. Yo pèmèt deteksyon nan mitasyon jenetik, chanjman epigenetik, ak lòt byomarkè enpòtan pou medikaman pèsonalize. Lè yo kenbe bon jan kalite cfDNA, tib sa yo asire rezilta serye nan tès byopsi likid. Kapasite yo pou estabilize cfDNA pandan transpò tou fè yo apwopriye pou tès desantralize, kote echantiyon yo kolekte nan kote aleka epi analize nan laboratwa santral.
Kalite tib koleksyon san an afekte anpil pwodiksyon cfDNA. Tib EDTA souvan pwodui pi ba pwodiksyon cfDNA konpare ak tib espesyalize. Yon analiz konparatif revele ke tib EDTA bay pi piti fragman cfDNA epi montre pi wo kontaminasyon nan ADN jenomik (gDNA). Kontrèman, tib espesyalize tankou Streck ak Cell-Free DNA BCT kenbe pi gwo pwodiksyon cfDNA ak pi gwo gwosè fragman pandan y ap minimize kontaminasyon gDNA.
| Kalite Tib | Sede cfDNA | Gwosè Fragman | Kontaminasyon gDNA |
|---|---|---|---|
| EDTA | Pi ba | Pi piti | Pi wo |
| Espesyalize | Pi wo | Pi gwo | Pi ba |
Plis etid yo montre ke tib EDTA reyalize a vle di pwa molekilè ki ba (LMW) cfDNA nan 1,925 GEs/mL plasma, pandan y ap tib ADN BCT san selil yo bay 1,591 GEs/mL apre 24 èdtan ak 1,514 GEs/mL apre 72 èdtan. Malgre ke diferans ki genyen nan sede yo pa estatistik enpòtan (ANOVA p = 0.439), tib espesyalize demontre pi bon estabilite sou tan.
Plizyè faktè enfliyanse cfDNA pite pandan ekstraksyon. Etap pre-analyse, tankou koleksyon san ak manyen, jwe yon wòl enpòtan. Liberasyon san entansyonèl nan ADN sovaj ki soti nan globil blan (WBC) pandan reta nan preparasyon plasma ka konpwomi pite cfDNA. Tib espesyalize tankou Cell-Free DNA BCT estabilize WBC yo, anpeche lage ADN ak amelyore pite cfDNA.
Tib EDTA estanda yo montre yon kontaminasyon enpòtan nan ADN WBC nan 24 èdtan apre yo fin pran san. Tib estabilize retade kontaminasyon sa a pou jiska 14 jou. Anplis de sa, plasma pi pito pase serom pou analiz cfDNA akòz pi ba kontaminasyon gDNA. Metòd santrifugasyon tou gen yon enpak sou bon jan kalite cfDNA, ak yon konbinezon de vitès ki ba ak gwo vitès santrifujasyon bay rezilta optimal.
Efikasite ekstraksyon cfDNA varye selon kalite tib ak twous ekstraksyon. Tib espesyalize depase tib EDTA lè yo konsève entegrite cfDNA, sa ki lakòz pi wo efikasite ekstraksyon. Pami twous ekstraksyon, QIAamp sikile twous asid nikleyik ran pi wo nan efikasite, ofri pwodiksyon siperyè ak pite. Twous NucleoSpin Plasma XS la bay bon pèfòmans men yon ti kras pi ba pwodiksyon, pandan y ap MagMAX Viral/Pathogen Nucleic Acid Isolation Twous la bay tan pwosesis pi vit men rezilta enkonsistan.
| Non Twous la | Ekstraksyon efikasite klasman | Nòt sou Pèfòmans |
|---|---|---|
| QIAamp sikile twous asid nikleyè | 1 | Segondè sede ak pite. |
| NucleoSpin Plasma XS | 2 | Bon pèfòmans men yon ti kras pi ba sede. |
| MagMAX Viral/Pathogen Asid Izolasyon Twous | 3 | Tan pwosesis rapid men rezilta varyab. |
Faktè pre-analitik, ki gen ladan tan pwosesis, kondisyon depo, ak metòd ekstraksyon, siyifikativman enfliyanse efikasite ekstraksyon cfDNA. Preparasyon plasma imedyat apre venpuncture rezilta nan pi kout fragman cfDNA, pandan y ap reta ka mennen nan fragman pi long ak pite redwi. Chwa a nan tib koleksyon san tou enpak sou sede cfDNA ak gwosè fragman. Tib espesyalize, konbine avèk pwotokòl santrifujasyon optimize, minimize variabilite pre-analitik ak amelyore rekiperasyon cfDNA.
Konsèvasyon cfDNA sou tan depann de kalite tib koleksyon san yo itilize ak kondisyon yo nan ki echantiyon yo estoke. Echantiyon Plasma yo kolekte nan tib EDTA yo apwopriye pou analiz cfDNA si trete nan sis èdtan. Reta pi lwen pase peryòd sa a ogmante risk pou kontaminasyon ADN jenomik, diminye estabilite cfDNA. Tib espesyalize, tankou cfDNA BCTs, bese risk sa yo pa estabilize globil blan ak anpeche liberasyon ADN.
Konsantrasyon ki ba nan cfDNA yo patikilyèman vilnerab a degradasyon pandan depo. Repete sik friz-dekonjle agrave pwoblèm sa a, espesyalman pou pi gwo fragman ADN. Sèvi ak tib polypropylène pou depo minimize absòpsyon ADN, plis prezève entegrite cfDNA. Mezi sa yo enpòtan anpil pou kenbe bon jan kalite plasma cfDNA, asire rezilta serye nan aplikasyon en.
Estabilizatè jwe yon wòl esansyèl nan kenbe estabilite cfDNA. Tib koleksyon san espesyalize, tankou Streck ak BCT ADN san selil, gen ajan chimik ki anpeche liz selil ak anpeche aktivite anzimatik. Sa a diminye liberasyon ADN jenomik nan plasma, prezève pite cfDNA. Etid yo montre ke tib sa yo kenbe bon jan kalite cfDNA egalman byen pou jiska twa jou. Sepandan, apre sèt jou, tib espesyalize depase tib EDTA nan anpeche degradasyon ak kontaminasyon. Karakteristik sa yo fè yo endispansab pou senaryo ki mande depo pwolonje oswa transpò.
Fluctuations tanperati a anpil enpak sou estabilite cfDNA. Echantiyon san ki estoke andeyò ranje rekòmande 6–37 °C eksperyans ogmante kontaminasyon ADN jenomik. Pou egzanp, depo nan 4 ° C oswa 40 ° C pou twa a senk jou mennen nan yon ogmantasyon remakab nan nivo ADN jenomik, konpwomèt kalite plasma. PAXgene Blood ccfDNA Tubes minimize emoliz epi kenbe entegrite cfDNA nan divès kondisyon. Echantiyon ki estoke nan tanperati chanm (jiska 25 ° C) pandan dis jou montre degradasyon minim, mete aksan sou enpòtans ki genyen nan chwazi tib koleksyon san apwopriye pou analiz cfDNA.
Dire depo dirèkteman afekte estabilite cfDNA. Preparasyon plasma imedyat apre koleksyon san asire pi bon kalite cfDNA. Si gen reta, echantiyon yo ta dwe refrijere nan 2-8 °C pou pa plis pase kat èdtan pou anpeche kontaminasyon. Tib espesyalize pwolonje tan depo san kondisyon kontwole, depase tib EDTA nan prezève entegrite cfDNA. Avansman sa yo pèmèt chèchè ak klinisyen yo kenbe echantiyon plasma bon jan kalite pou peryòd pwolonje, fasilite analiz cfDNA serye.
Chèchè yo ta dwe priyorite bon jan kalite tib koleksyon san asire estabilite cfDNA epi minimize varyasyon nan eksperyans en. Tib dedye, tankou PAXgene Blood ccfDNA Tubes, estabilize cfDNA nan echantiyon san antye epi redwi emoliz pandan transpò oswa depo. Plasma se kalite echantiyon pi pito pou analiz cfDNA akòz pi ba risk li yo nan kontaminasyon konpare ak serom. Chèchè k ap fè etid gwo echèl oswa kolaborasyon milti-sit ta dwe chwazi tib ki kenbe entegrite cfDNA nan divès kondisyon. Apwòch sa a asire ekstraksyon serye cfDNA ak pirifikasyon pou etid biomarker.
Nan anviwònman klinik yo, chwa tib koleksyon san yo depann de egzijans espesifik analiz cfDNA yo. Echantiyon Plasma yo souvan pi pito pou rezon dyagnostik, paske yo bay pite cfDNA ki pi wo. Klinisyen yo dwe verifye konpatibilite anticoagulant yo ak tès ki vin apre yo pou evite konpwomèt rezilta yo. Tib espesyalize, tankou Streck oswa BCT ADN san selil, yo ideyal pou konsève cfDNA pandan transpò nan laboratwa santral yo. Tib sa yo anpeche selil liz epi kenbe estabilite cfDNA, asire rezilta egzat pou tès byopsi likid ak lòt aplikasyon dyagnostik.
Kondisyon depo apwopriye yo esansyèl pou kenbe estabilite cfDNA. Echantiyon san yo ta dwe trete san pèdi tan pou anpeche degradasyon. Si pwosesis imedyat pa posib, refrijerasyon nan 2-8 ° C pou jiska kat èdtan. Pou depo alontèm, echantiyon plasma yo ta dwe estoke nan -80 ° C pou konsève entegrite cfDNA. Sèvi ak PAXgene Blood ccfDNA Tubes asire estabilite pandan depo ak anbake, menm nan kondisyon tanperati varye. Pratik manyen ki konsistan diminye risk pou degradasyon cfDNA.
Minimize kontaminasyon pandan depo ak manyen cfDNA se kritik pou analiz serye. Tib koleksyon san bon jan kalite anpeche liz selil epi redwi kontaminasyon ADN jenomik. Pwotokòl estanda pou preparasyon plasma, santrifujasyon, ak depo plis amelyore pite cfDNA. Evite repete sik friz-dekonjle epi itilize tib polypropylène pou estokaj ede kenbe bon jan kalite cfDNA. Mezi sa yo asire ke ekstraksyon cfDNA ak pirifikasyon bay rezilta egzat ak repwodiktif.
Chwazi bon an tib koleksyon ADN san selil esansyèl pou analiz cfDNA serye. Chwa tib dirèkteman enfliyanse bon jan kalite cfDNA nan estabilize echantiyon yo epi anpeche liberasyon ADN sovaj nan globil blan. Tib espesyalize, tankou cfDNA BCTs, depase opsyon estanda pa kenbe entegrite cfDNA pou jiska 14 jou. Plasma, pi pito pase serom akòz estabilite li yo ak pi ba risk kontaminasyon, plis amelyore fyab analiz. Faktè sa yo mete aksan sou wòl enpòtan seleksyon tib nan asire rezilta egzat pou rechèch ak aplikasyon klinik.
